lunes, 7 de agosto de 2017

Virus desconocido descubierto en ADN "desechable" . Fuente: Universidad de Oxford

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Un descubrimiento casual ha abierto un nuevo método para encontrar virus desconocidos. (Imagen de archivo)
Crédito: © natali_mis / Fotolia
Un descubrimiento casual ha abierto un nuevo método para encontrar virus desconocidos.
En la investigación publicada en la revista Virus Evolution , científicos del Departamento de Zoología de la Universidad de Oxford han revelado que la Secuenciación de Próxima Generación y sus bases de datos de ADN en línea asociadas podrían ser utilizadas en el campo del descubrimiento viral. Ellos han desarrollado algoritmos que detectan el ADN de los virus que se encuentran en la sangre de los peces o muestras de tejidos, y podría ser utilizado para identificar los virus en una gama de diferentes especies.
Next-Generation Sequencing ha revolucionado la investigación genómica y se utiliza actualmente para estudiar y comprender el material genético. Permite a los científicos recopilar grandes cantidades de datos, a partir de una sola pieza de ADN, que luego se agrupan en enormes, en línea, las bases de datos del genoma que son de acceso público.
El Dr. Aris Katzourakis y el Dr. Amr Aswad, Asociados de Investigación del Departamento de Zoología de Oxford, descubrieron inicialmente el nuevo uso de la base de datos, por casualidad. Mientras buscaban un virus herpes antiguo en primates, encontraron evidencia de dos nuevos virus indocumentados.
Estimulados por su descubrimiento accidental, se dispusieron a ver si podían lograr el mismo resultado intencionalmente. En un proyecto separado para encontrar nuevos virus de herpes infectantes de peces, utilizaron la técnica para examinar más de 50 genomas de peces para identificar el ADN viral. Sin duda, además de los virus del herpes que esperaban encontrar, los investigadores identificaron un linaje lejano de virus inusuales - que incluso puede ser una nueva familia viral. Los rasgos se encontraron dispersos en fragmentos de 15 especies diferentes de peces, incluyendo el salmón del Atlántico y la trucha arco iris.
Para confirmar que la evidencia viral no fue simplemente una casualidad, o un error de procesamiento de datos, probaron muestras adicionales de un supermercado local y un restaurante de sushi. Se encontraron los mismos fragmentos virales en las muestras compradas.
Según el autor del estudio, el Dr. Aris Katzourakis, del Departamento de Zoología de la Universidad de Oxford, dijo: "En el genoma del salmón encontramos un genoma viral completo e independiente, así como decenas de fragmentos de ADN viral que se habían integrado en el ADN de los peces. Sabemos por estudios recientes que los virus son capaces de integrarse en el genoma de su huésped, a veces permaneciendo allí durante millones de años. En este caso, parece que el virus pudo haber adquirido la capacidad de integrarse al robar un gen del propio salmón, lo que explica cómo se ha extendido tanto en el genoma del salmón.
La clave del éxito de esta investigación radica en su enfoque interdisciplinario, combinando técnicas de dos campos: biología evolutiva y genómica. Juntos, éstos están en el centro del nuevo campo de paleovirología - el estudio de virus antiguos que han integrado su ADN en el de sus huéspedes, a veces hace millones de años. Cada técnica utilizada se ha desarrollado para analizar grandes cantidades de datos de secuencia de ADN.
Co-autor e investigador asociado en el Departamento de Zoología de Oxford y St. Hilda's College, el Dr. Amr Aswad, dijo: "El descubrimiento de nuevos virus históricamente ha sido sesgada hacia las personas y los animales que muestran síntomas de la enfermedad. Pero, nuestra investigación muestra cómo la secuenciación del ADN de próxima generación puede ser útil en la identificación viral. Para muchos, el ADN viral, por ejemplo, el chimpancé o los datos del halcón es una molestia, y un contaminante pícaro que necesita ser filtrado de los resultados. Pero consideramos que estas son una oportunidad a la espera de ser explotadas, ya que podrían incluir nuevos virus que valen la pena estudiar - como hemos encontrado en nuestra investigación. Podríamos arrojar datos muy valiosos.
Históricamente, encontrar nuevos virus no ha sido un proceso fácil. Las células no crecen por sí solas, por lo que deben ser cultivadas en un laboratorio antes de que puedan ser analizadas, lo que implica meses de trabajo. Pero la investigación de Oxford representa una gran oportunidad para el futuro.
Más allá de este estudio, el enfoque podría ser utilizado para identificar virus en una gama de diferentes especies, en particular las conocidas por albergar la enfermedad transmisible. Los murciélagos y los roedores, por ejemplo, son portadores notorios de enfermedades infecciosas a las que aparentemente son inmunes. Los insectos como los mosquitos también son portadores de enfermedades virales que dañan a los seres humanos, como Zika. Si se aplica de manera eficaz, el método podría descubrir otros virus antes de que ocurra un brote.
El Dr. Katzourakis añadió: "Una de las fortalezas reales de esta técnica, en comparación con los enfoques virológicos más tradicionales, es la velocidad del descubrimiento y la falta de confianza en la identificación de un individuo enfermo. Los datos virales recolectados, que de otro modo podrían descartarse como una molestia, son un recurso único para buscar virus patógenos y benignos que de otro modo hubieran permanecido sin descubrir.
El equipo comenzará a identificar el impacto de los virus y si tienen alguna implicación a largo plazo para la enfermedad, o la piscicultura comercial. Mientras que un virus infeccioso no puede causar enfermedad en su huésped natural - en este caso, los peces. Existe un riesgo de transmisión de especies entre peces de granja o poblaciones silvestres.
Sin embargo, el riesgo para los seres humanos es mínimo. El Dr. Aris Katzourakis dijo: 'Puesto de esta manera, no voy a dejar de comer sashimi'.

Fuente de la historia:
Materiales suministrados por la Universidad de Oxford . Nota: El contenido puede ser editado para el estilo y la longitud.

Referencia del Diario :
  1. Amr Aswad, Aris Katzourakis. Un nuevo linaje viral distante relacionado con herpesvirus descubierto dentro de los datos de la secuencia del genoma de peces . Virus Evolution , 2017; 3 (2) DOI: 10.1093 / ve / vex016

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